自增主键没有持久化是个比较早的bug，这点从其在官方bug网站的id号也可看出（https://bugs.MySQL.com/bug.php?id=199）。由Peter Zaitsev（现Percona CEO）于2003年提出。历史悠久且臭名昭著。
首先，直观的重现下。
mysql> create table t1(id int auto_increment primary key);
Query OK, 0 rows affected (0.01 sec)
mysql> insert into t1 values(null),(null),(null);
Query OK, 3 rows affected (0.01 sec)
Records: 3 Duplicates: 0 Warnings: 0
mysql> select * from t1;
+----+
| id |
+----+
| 1 |
| 2 |
| 3 |
+----+
3 rows in set (0.00 sec)
mysql> delete from t1 where id=3;
Query OK, 1 row affected (0.36 sec)
mysql> insert into t1 values(null);
Query OK, 1 row affected (0.35 sec)
mysql> select * from t1;
+----+
| id |
+----+
| 1 |
| 2 |
| 4 |
+----+
3 rows in set (0.01 sec)
虽然id为3的记录删除了，但再次插入null值时，并没有重用被删除的3，而是分配了4。
删除id为4的记录，重启数据库，重新插入一个null值。
mysql> delete from t1 where id=4;
# service mysqld restart
mysql> insert into t1 values(null);
Query OK, 1 row affected (0.00 sec)
mysql> select * from t1;
+----+
| id |
+----+
| 1 |
| 2 |
| 3 |
+----+
3 rows in set (0.00 sec)
可以看到，新插入的null值分配的是3，按照重启前的操作逻辑，此处应该分配5啊。
这就是自增主键没有持久化的bug。究其原因，在于自增主键的分配，是由InnoDB数据字典内部一个计数器来决定的，而该计数器只在内存中维护，并不会持久化到磁盘中。当数据库重启时，该计数器会通过下面这种方式初始化。
SELECT MAX(ai_col) FROM table_name FOR UPDATE;
MySQL 8.0的解决思路
将自增主键的计数器持久化到redo log中。每次计数器发生改变，都会将其写入到redo log中。如果数据库发生重启，InnoDB会根据redo log中的计数器信息来初始化其内存值。为了尽量减小对系统性能的影响，计数器写入到redo log中，并不会马上刷新。具体可参考：https://dev.mysql.com/worklog/task/?id=6204
因自增主键没有持久化而出现问题的常见场景：
1. 业务将自增主键作为业务主键，同时，业务上又要求主键不能重复。
2. 数据会被归档。在归档的过程中有可能会产生主键冲突。
所以，强烈建议不要使用自增主键作为业务主键。刨除这两个场景，其实，自增主键没有持久化的问题并不是很大，远没有想象中的”臭名昭著“。
最后，给出一个归档场景下的解决方案，
创建一个存储过程，根据table2（归档表）自增主键的最大值来初始化table1（在线表）。这个存储过程可放到init_file参数指定的文件中，该文件中的SQL会在数据库启动时执行。
DELIMITER ;;
CREATE PROCEDURE `auto_increment_fromtable2`(IN table1 VARCHAR(255), IN table2 VARCHAR(255))
BEGIN
set @qry = concat('SELECT @max1 := (`id` + 1) FROM `',table1,'` ORDER BY `id` DESC LIMIT 1;');
prepare stmt from @qry;
execute stmt;
deallocate prepare stmt;
set @qry = concat('SELECT @max2 := (`id` + 1) FROM `',table2,'` ORDER BY `id` DESC LIMIT 1;');
prepare stmt from @qry;
execute stmt;
deallocate prepare stmt;
IF @max1 < @max2 THEN
set @qry = concat('alter table `',table1,'` auto_increment=',@max2);prepare stmt from @qry;execute stmt;deallocate prepare stmt;
SELECT 'updated' as `status`;
else
SELECT 'no update needed' as `status`;
END IF;
END ;;
DELIMITER ;