继续深入下去，我发现当你明确地手工保存会话时，之后保存第一个文件而不会保存第二个文件。 但是当登出保存会话时则会保存第二个文件。 因此， 我进入“设置 -> 会话和启动”中，在“通用”标签页中启用登出时自动保存会话， 然后登出后再进来， 然后， 第二个文件就出现了。 再然后我又关闭了登出时自动保存会话。（因为我一般在排好屏幕后就保存一个会话， 但是我不希望做出的改变也会影响到这个保存的会话， 如有必要我会明确地手工进行保存），现在我的窗口位置能够正常的恢复了。
这也解释了为什么有的人会有问题而有的人没有问题： 有的人可能一直都是用登出按钮重启，而有些人则是手工重启（或者仅仅是由于系统崩溃了才重启）。
顺带一提，这类问题， 以及为解决问题而付出的努力，正是我赞同为软件存储的状态文件编写 man 页或其他类似文档的原因。 为用户编写文档，不仅能帮助别人深入挖掘产生奇怪问题的原因， 也能让软件作者注意到软件中那些奇怪的东西， 比如将会话状态存储到两个独立的文件中去。