每个 Linux 程序都是一个可执行文件，它含有操作码列表，CPU 将执行这些操作码来完成特定的操作。例如，ls 命令是由 /bin/ls 文件提供的，该文件含有机器指令的列表，在屏幕上显示当前目录中文件的列表时需要使用这些机器指令。几乎每个程序的行为都可以通过修改其配置文件来按照您的偏好或需要去定制。
Linux 中有没有一个标准的配置文件格式？
一句话，没有。不熟悉 Linux 的用户（一定）会感到沮丧，因为每个配置文件看起来都象是一个要迎接的新挑战。在 Linux 中，每个程序员都可以自由选择他或她喜欢的配置文件格式。可以选择的格式很多，从 /etc/shells 文件（它包含被一个换行符分开的 shell 的列表），到 Apache 的复杂的 /etc/httpd.conf 文件。
什么是系统配置文件？
内核本身也可以看成是一个“程序”。为什么内核需要配置文件？内核需要了解系统中用户和组的列表，进而管理文件权限（即根据权限判定特定用户（UNIX_USERS）是否可以打开某个文件）。注意，这些文件不是明确地由程序读取的，而是由系统库所提供的一个函数读取，并被内核使用。例如，程序需要某个用户的（加密过的）密码时不应该打开 /etc/passwd 文件。相反，程序应该调用系统库的 getpw() 函数。这种函数也被称为系统调用。打开 /etc/passwd 文件和之后查找那个被请求的用户的密码都是由内核（通过系统库）决定的。
除非另行指定，Red Hat Linux 系统中大多数配置文件都在 /etc 目录中。配置文件可以大致分为下面几类：
访问文件
/etc/host.conf 告诉网络域名服务器如何查找主机名。（通常是 /etc/hosts，然后就是名称服务器；可通过 netconf 对其进行更改）
/etc/hosts 包含（本地网络中）已知主机的一个列表。如果系统的 IP 不是动态生成，就可以使用它。对于简单的主机名解析（点分表示法），在请求 DNS 或 NIS 网络名称服务器之前，/etc/hosts.conf 通常会告诉解析程序先查看这里。
/etc/hosts.allow 请参阅 hosts_access 的联机帮助页。至少由 tcpd 读取。
/etc/hosts.deny 请参阅 hosts_access 的联机帮助页。至少由 tcpd 读取。
引导和登录／注销
/etc/issue & /etc/issue.net 这些文件由 mingetty（和类似的程序）读取，用来向从终端（issue）或通过 telnet 会话（issue.net）连接的用户显示一个“welcome”字符串。它们包括几行声明 Red Hat 版本号、名称和内核 ID 的信息。它们由 rc.local 使用。
/etc/RedHat-release 包括一行声明 Red Hat 版本号和名称的信息。由 rc.local 使用。
/etc/rc.d/rc 通常在所有运行级别运行，级别作为参数传送。例如，要以图形（Graphics）模式（X-Server）引导机器，请在命令行运行下面的命令：init 5。运行级别 5 表示以图形模式引导系统。
/etc/rc.d/rc.local 非正式的。可以从 rc、rc.sysinit 或 /etc/inittab 调用。
/etc/rc.d/rc.sysinit 通常是所有运行级别的第一个脚本。
/etc/rc.d/rc/rcX.d 从 rc 运行的脚本（X 表示 1 到 5 之间的任意数字）。这些目录是特定“运行级别”的目录。当系统启动时，它会识别要启动的运行级别，然后调用该运行级别的特定目录中存在的所有启动脚本。例如，系统启动时通常会在引导消息之后显示“entering run-level 3”的消息；这意味着 /etc/rc.d/rc3.d/ 目录中的所有初始化脚本都将被调用。