配置GNU/Linux的工作不是说安装光盘弹出来后，甚至不是说安装后向导运行后就算完成了。虽说安装后你面对的是个基本系统，却不是你的所有偏好和需求都已经考虑在内的优化后系统。考虑到操作系统的大小和复杂性，别指望系统安装后就让你称心如意--在Windows上完成安装后基本上也是这种情形。
要是你对GNU/Linux有所了解，也许知道你不需要碎片整理工具，也不需要为反病毒软件过于操心。但是你还需要做其他的什么事情呢？就这个问题而言，大多数发行版基本上保持沉默，不过安装自己的操作系统的用户数量只是所有计算机用户中的一小部分。现在，你甚至无法想当然地认为所有GNU/Linux用户都安装了自己的操作系统。
为了弥补这个不足，你在安装GNU/Linux后应该考虑下列九个步骤。我花了好多个晚上调整自己家里的众多桌面计算机后才写成了这篇指南文章。逐一遵照这些步骤是要花些时间，但如果你果真这么做，就有助于确保你在使用新安装的操作系统时更轻松自如。
一、更新你的系统
新版本的自由软件程序在不断发布出来。由于这个原因，来自你已安装系统的CD或DVD映像文件已经过时的可能性相当大。正因为如此，你在安装后的第一步应该是升级系统。除了你自然希望拥有最新的工具不说，你还会得到最新的安全补丁。你会在基本上毋需解释的桌面面板上的通知托盘中找到更新图标。
二、启用安全功能
就因为GNU/Linux不受病毒困扰、采用了安全设计，并不是说你就可以随便冒险了。一旦你更新了系统，应该采取的下一步是，确保你系统的安全工具在为你发挥作用。
在Debian、Fedora、Gentoo、Mandrake、红帽和SUSE等发行版上，你能够采取的最重要的一个步骤就是，安装和运行Bastille.bastille是一个系统加固工具，同时可以教你一些安全常识，建议采取确保系统安全的标准方法，并提议为什么可能需要各个选项.bastille的开发者Jay Beale建议，该工具的选项也许是你所需要的安全机制。
不过，要是你的发行版有SELinux或AppArmor，你可能还要考虑使用它们来加强安全。这么做的话，系统性能可能会下降几个百分点，但是性能受影响的程度小于在后台运行病毒扫描工具。
尤其是SELinux以配置困难而出名，但在Fedora等一些发行版中，它又是安装的一个标准部分，图形化工具可以处理它的一些基本操作。
你在考虑安全时，如果你与Windows用户交换文件，或者与同一台计算机上安装的Windows系统（下文有介绍）交换文件，可能还应该安装Clam反病毒工具。你的GNU/Linux发行版不需要它，但安装的Windows系统可能需要它。
三、安装打印机
如今，GNU/Linux安装程序、尤其是面向新用户的那些安装程序，通常能检测到你的大部分硬件，包括互联网连接。但由于某个原因，大多数安装程序（包括Windows的安装程序）忽略了打印机配置，尽管普通计算机已连接至打印机。
幸好，如今打印机配置起来很容易。你需要的工具是GNOME菜单中的System（系统）> Administration（管理）> Printing（打印），以及KDE 4菜单中的Administration（管理）> Printing（打印）。你可能想要以根用户的身份安装，那样每个人可以使用该打印机，不过你在KDE中的确有这个选项：只为当前帐户启用打印机。无论借助上述哪种工具，你都需要插上计算机，然后按指示操作。
如果你的打印机没有列出来，可以到Linux打印机数据库里面找找。可能会找到关于让你那台打印机正常工作的其他驱动程序的信息。如果是PostScript打印机，你在按指示操作时，只需要选择通用PostScript驱动程序。
四、选择和配置电子软件阅读器
就跟在Windows上一样，在GNU/Linux上，你也需要在安装后配置电子邮件阅读器，输入用于收发邮件的信息，比如地址、密码和服务器。你可以从现有的操作系统获得这些信息；必要的话，也可以从你的互联网服务提供商（ISP）获得这些信息。
自由软件至少包括十几种邮件阅读器，但最常见的是GNOME的Evolution、KDE的KMail和Thunderbird（火狐Web浏览器的配套应用程序）。对习惯使用Outlook的那些用户而言，Evolution似乎最熟悉，它有内置的联系人列表和备忘录，但是上述这三款应用程序在功能特性上都大体相似.thunderbird尤其大受欢迎，因为它在Windows上也可以使用。