/sbin：系统执行文件（二进制），这些文件不打算被普通用户使用。（普通用户仍然可以使用它们，但要指定目录。）
/etc：特定机器的配置文件。
/root：系统管理员（也叫超级用户或根用户）的Home目录。
/lib：根文件系统上的程序所需的共享库。
/boot：引导加载器(bootstrap loader)使用的文件，如LILO。核心映象也经常在这里，而不是在根目录。如果有许多核心映象，这个目录可能变得很大，这时可能使用单独的文件系统更好。另一个理由是要确保核心映象必须在IDE硬盘的前1024柱面内。当计算机启动时（如果有多个操作系统，有可能允许你选择启动哪一个操作系统），这些文件首先被装载。这个目录也会包含LINUX核（压缩文件 vmlinuz），但LINUX核也可以存在别处，只要配置LILO并且LILO知道LINUX核在哪儿。
/dev：设备文件目录。LINUX下设备被当成文件，这样一来硬件被抽象化，便于读写、网络共享以及需要临时装载到文件系统中。正常情况下，设备会有一个独立的子目录。这些设备的内容会出现在独立的子目录下。LINUX没有所谓的驱动符。
/tmp：临时文件。引导启动后运行的程序应该使用/var/tmp ，而不是/tmp ，因为前者可能在一个拥有更多空间的磁盘上。该目录会被自动清理干净。 /mnt：系统管理员临时mount的安装点。程序并不自动支持安装到/mnt 。 /mnt 可以分为子目录(例如/mnt/dosa 可能是使用MSDOS文件系统的软驱，而/mnt/exta 可能是使用ext2文件系统的软驱)。
/opt：可选的应用程序，譬如，RedHat 5.2下的KDE （REDHAT 6.0下，KDE放在其它的X-WINDOWS应用程序中，主执行程序在/usr/bin目录下 /lost+found：在文件系统修复时恢复的文件。
下面就以上部分目录的部分子目录功能加以说明：
/usr文件系统 /usr 文件系统经常很大，因为所有程序安装在这里。 /usr 里的所有文件一般来自Linux distribution；本地安装的程序和其他东西在/usr/local 下。这样可能在升级新版系统或新distribution时无须重新安装全部程序。 /usr/X11R6：X Window系统的所有文件。为简化X的开发和安装，X的文件没有集成到系统中。 X自己在/usr/X11R6 下类似/usr 。
/usr/X386：类似/usr/X11R6 ，但是给X11 Release 5的。
/usr/bin：几乎所有用户命令。有些命令在/bin 或/usr/local/bin 中。 /usr/sbin：根文件系统不必要的系统管理命令，例如多数服务程序。 /usr/man、/usr/info、/usr/doc：手册页、GNU信息文档和各种其他文档文件。