主要的安装过程
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Ubuntu 10.10中
【1】Ubuntu系统的初步配置。
打开终端,具体方式是applications-->accessories-->terminal。
运行 :
sudo apt-get install gfortran
sudo apt-get install build-essential
sudo apt-get install libx11 -dev
sudo apt-get install csh
sudo apt-get install tcsh
sudo apt-get install gmt
【2】安装GAMIT。
在terminal中
运行:
cd /opt/Gamit 进入/opt/GamitGlobk目录
chmod +x install_software 执行install_software安装脚本,给予该文件可执行属性
./install_software
【3】设置环境变量和命令路径
在terminal中
运行:
echo $SHELL 查看当前的shell
如果是/bin/bash
则
在系统的 etc 目录下,有一个 profile 文件,编辑该文件:
$gedit /etc/profile
在最后边加入需要设置变量的shell语句
PATH="$PATH:/opt/Gamit/gamit/bin:/opt/Gamit/com:/opt/Gamit/kf/bin"
HELP_DIR=/opt/Gamit/help/
export PATH HELP_DIR该文件编辑保存后,重启系统,变量生效。
如果想要在csh环境下,则在终端输入
tcsh
再输入/bin/csh
重启,则系统改为csh环境。
接着,在cshrc文件中加入
PATH="$PATH:/opt/Gamit/gamit/bin:/opt/Gamit/com:/opt/Gamit/kf/bin"
HELP_DIR=/opt/Gamit/help/
export PATH HELP_DIR
该文件编辑保存后,重启系统,变量生效。
【4】验证
在terminal中
运行:
doy
如果有显示日期等,安装基本成功。
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遇到的问题
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【1】HELP_DIR=/opt/Gamit/help/ 因为对文件夹不熟悉,我写的是“HELP_DIR=/opt/Gamit/help”,
结果一直遇到错误如下
**ERROR** Opening help file.
Check that enviroment variable HELP_DIR points to directory with help files.
IOSTAT error 2 occurred openingdoy.hlp in doy
WARNING:110228:2352:38.0 DOY/doy: IOSTAT error opening file doy.hlp ERROR 2
很久才检查出这个错误。
【2】因为是在虚拟机中安装的Ubuntu和gamit,所以必须保证有足够的内存。
因为内存分配不足,之前安装过两次,都一直出现错误的情况。这样的问题是第二次了,只要看到Killed字样,就要考虑系统内存分配问题。
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一些常用命令行语句
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source /etc/csh.cshrc 保存修改? 这一句一直出现错误提示“syntax error near unexpected token'('” ,不知道为何?
sudo apt-get install rar unrar p7zip %rar文件压缩解压缩
参考文献