使用不同版本的patch问题来源可能不同，所有的版本在网络上都是可用的。Larry Wall近年来已经不再做很多工作来更新patch了，这可能是由于他最后发行的一个版本在大部分情况下都能正常运行。最近几年以来，一直是GNU项目的 FSF程序员发行新版本的patch。他们首先修订有问题的patch，但是我最近一直使用没有问题的2.5版本（这是Debian2.0的发行版本号）。过去，我的2.1版本也一直运行的很好。当前的GNU patch的版本可以从GNU FTP站点上获取，然而大部分人都只使用他们Linux发行版中所提供的版本。
让我们假定你已经对一个目录下的源程序文件进行了patch修补工作，但是patch并没有清晰地发挥作用。这可能会偶然发生，在打补丁的过程中会显示错误信息，其中带有行号，说明哪一个文件出现了问题。有时错误是很明显的，例如缺少了分号，这种错误可以不费多大力气就能改正。另外一种可能是从 patch部分删除了产生问题的部分，但是这样根据所涉及到的文件的不同可能会正常工作，也可能不能正常工作了。
另外一种常见的错位为：假设你有一个未使用tar打包的内核源程序文件，在/linux/arch/下浏览各个子目录时你会发现各种机器体系结构子目录，例如alpah、sparc等等。如果你和大多数Linux用户一样，使用的是Intel的处理器（或者是Intel系列），你可以决定删除这些目录，这些目录对于编译你特殊的内核并不需要，只是白白占用了磁盘空间。一段时间之后发行了一个新的内核patch，此时试图进行patch操作，当它发现不能找到自己打补丁需要的Alpha或者PPC文件，就会停顿下来。幸运的是patch在这些地方允许用户参与，它会询问Skip this patch?回答y，patch就可以按照正确的路径继续执行。也许你需要回答这个问题很多次，因此允许自己不需要的目录保留在磁盘上是一种很好的方法。
