程序开发：GCC, make, ld, Scheme48, j2sdk, Perl, Python, Tcl/Tk ...
编码工具：kdevelop(用于编写qt、php、java、c/c++等语言代码的工具)
程序跟踪工具：strace（其后跟可执行文件）,这是一个去跟踪程序究竟在做什么的非常有价值的工具。比如它可以追踪到一个C文件里面的每一行调用了一个什么系统调用函数。
生成Makefile文件工具：autogen、tmake、qmake
论文，幻灯工具：LaTeX, ConTeXt
绘图工具：MetaPost。这个语言太强了，以至于我只用它了。你不熟悉的话可以用xfig, dia 来画一些流程图之类的图片。
图像处理：ImageMagick。其中的 import 程序可以屏幕抓图，convert 程序可以转换图像格式，display 可以显示图片和简单编辑(缩放，换质量，转格式，简单绘图，简单虑镜)。通常我就这么点需要。如果你要更强大的图像工具可以用 Gimp, 它几乎和Photoshop差不多。
自动管理工具：make。我可以用make来自动编译程序，自动编译文档，自动更新插图…… 全自动，而且不会重复劳动。
截屏工具：scrot
数值计算程序：SciLab。这个程序基本上可以代替 Matlab。
代数计算程序：MAXIMA。这个程序基于世界上最老的计算机代数系统之一: 由美国能源部(DOE)发行的 MIT Macsyma系统。它是用 Common Lisp 实现的。很多现在的符号计算程序比如 Maple 都从 MAXIMA 身上学到很多东西。它现在经过 DOE 批准以GPL发行，永远是一个自由软件。
加密程序：GnuPG。我的 PGP 密钥就是它搞出来的。
打包，压缩程序: tar, gzip, bzip2, zip, rar, ...
虚拟光驱程序：Linux不需要虚拟光驱程序，直接 mount 就行了。
ftp 服务器：proftpd, vsftpd。proftpd 功能很强，但是我只用了最简单的一种设置。
WWW 服务器：apache。(我一般没有开)