一、PHP中调用外部命令介绍
二、关于安全问题
三、关于超时问题
四、关于PHP运行linux环境中命令出现的问题
一、PHP中调用外部命令介绍
在PHP中调用外部命令，可以用，1>调用专门函数、2>反引号、3>popen()函数打开进程，三种方法来实现：
方法一：用PHP提供的专门函数（四个）：
PHP提供4个专门的执行外部命令的函数：exec(), system(), passthru(), shell_exec()
1）exec()
原型: string exec ( string $command [, array &$output [, int &$return_var ］ )
说明: exec执行系统外部命令时不会输出结果，而是返回结果的最后一行。如果想得到结果，可以使用第二个参数，让其输出到指定的数组。此数组一个记录代表输出的一行。即如果输出结果有20行，则这个数组就有20条记录，所以如果需要反复输出调用不同系统外部命令的结果，最好在输出每一条系统外部命令结果时清空这个数组unset($output)，以防混乱。第三个参数用来取得命令执行的状态码，通常执行成功都是返回0。
<?php exec("dir",$output); print_r($output); ?>
2）system()
原型: string system ( string $command [, int &$return_var ] )
说明: system和exec的区别在于，system在执行系统外部命令时，它执行给定的命令，输出和返回结果。第二个参数是可选的，用来得到命令执行后的状态码。
<?php system("pwd",$result); print $result;//输出命令的结果状态码 ?>
关于第二个参数结果状态码的简单介绍：
如果返回0是运行成功，
在Bash中，当错误发生在致命信号时，bash会返回128+signal number做为返回值。
如果找不到命令，将会返回127。
如果命令找到了，但该命令是不可执行的，将返回126。
除此以外，Bash本身会返回最後一个指令的返回值。
若是执行中发生错误，将会返回一个非零的值。
Fatal Signal : 128 + signo
Can't not find command : 127
Can't not execute : 126
Shell script successfully executed : return the last command exit status
Fatal during execution : return non-zero
3）passthru()
原型： void passthru ( string $command [, int &$return_var ] )
说明: passthru与system的区别，passthru直接将结果输出到游览器，不返回任何值，且其可以输出二进制，比如图像数据。第二个参数可选，是状态码。
<?php header("Content-type:image/gif"); passthru("/usr/bin/ppm2tiff /usr/share/tk8.4/demos/images/teapot.ppm"); ?>
4）shell_exec()
原型: string shell_exec ( string $cmd )
说明: 直接执行命令$cmd
<?php $output = shell_exec('ls -lart'); echo "<pre>$output</pre>"; ?>
方法二：反撇号
原型: 反撇号`（和~在同一个键）执行系统外部命令
说明: 在使用这种方法执行系统外部命令时，要确保shell_exec函数可用，否则是无法使用这种反撇号执行系统外部命令的。
<?php echo `dir`; ?>
方法三：用popen()函数打开进程
原型: resource popen ( string $command , string $mode )
说明: 能够和命令进行交互。之前介绍的方法只能简单地执行命令，却不能与命令交互。有时须向命令输入一些东西，如在增加系统用户时，要调用su来把当前用户换到root用户，而su命令必须要在命令行上输入root的密码。这种情况下，用之前提到的方法显然是不行的。
popen( )函数打开一个进程管道来执行给定的命令，返回一个文件句柄，可以对它读和写。返回值和fopen()函数一样，返回一个文件指针。除非使用的是单一的模式打开(读or写)，否则必须使用pclose()函数关闭。该指针可以被fgets(),fgetss(),fwrite()调用。出错时，返回FALSE。
<?php error_reporting(E_ALL); /* Add redirection so we can get stderr. */ $handle = popen('/path/to/executable 2>&1', 'r'); echo "'$handle'; " . gettype($handle) . "\n"; $read = fread($handle, 2096); echo $read; pclose($handle); ?>
二、关于安全问题：
由于PHP基本是用于WEB程序开发的，所以安全性成了人们考虑的一个重要方面。
于是PHP的设计者们给PHP加了一个门：安全模式。
在php.ini中的设置safe_mode = On
如果运行在安全模式下，那么PHP脚本中将受到如下四个方面的限制：
执行外部命令
在打开文件时有些限制
连接MySQL数据库
基于HTTP的认证