Ubuntu Linux的发行版本有Ubuntu（安装gnome桌面环境）、Kubuntu（安装kde桌面环境）、Xubuntu（安装xfce桌面环境）、Edubuntu（面向年轻人和学生用户的版本，安装gnome桌面环境）、goubuntu等。
用Wubi可以轻松地完成以上各版本Linux（除goubuntu）和UbuntuStudio的安装。安装了以上各版本的Ubuntu之一的用户如果想用一其他的桌面环境，可以下载各桌面环境的安装包单独安装，在登录时选择要登录的桌面环境。但是能不能同时安装多个Linux系统呢？答案是肯定的。下面以已经安装了Ubuntu的情况下再安装Kubuntu为例说明如何用Wubi同时安装多个Linux系统。
首先，修改C:\wubi\disks\system.virtual.disk的的名字（如改为ubuntu.virtual.disk），重新安装桌面环境选择Kubuntu
安装完成后，进入Window系统再修改C:\wubi\disks\system.virtual.disk的名字（如改为kubuntu.virtual.disk），现在就有C:\wubi\disks\ubuntu.virtual.disk、C:\wubi\disks\kubuntu.virtual.disk两个虚拟磁盘了。接下来编辑C:\wubi\boot\grub\menu.lst：
找到hiddenmenu选项，在前面加一个“#”字号，在启动时就会显示选择菜单。
再找到timeout选项，设置启动默认选项前的等待时间。