复制集成员的重新同步
当复制失败，且落后于 primary 中oplog最大可承受的范围的时候，replica set 成员将变为 “陈旧” （stale）。该节点无法追上主节点就变的 “陈旧”了。当发生这种情况时，我们就不得不删除其数据文件，并通过 initial sync 来重新同步。
本教程包含了为陈旧的节点重新同步与新节点重新同步。当同步一个节点的时候，请确保机器有足够的空余带宽，并尽量在维护时间内进行，或是业务最不繁忙时。
MongoDB提供2中初始化同步（initial sync）的方式：
a.清空数据目录，重启 mongod 实例，让MongoDB进行正常的初始化同步。这是个简单的方式，但是耗时较长。
b.为该机器从其他节点上复制一份最近的数据文件，并重启。本方式操作步骤较多，但是最为快速。
步骤
自动同步
警告
在初始化同步的过程中，mongod 将会清空 dbPath 中的内容。
该步骤依靠MongoDB 自身的定期进程 initial sync 。这将恢复节点上最新的数据。有关MongoDB初始化恢复，请参考 复制过程 。
如果该实例没有数据，我们可以通过 为复制集新增节点 或是 更换复制集节点 来为复制集新增一个节点。
我们也可以通过指定一个空的 dbPath 并重启来将一个复制集中的 mongod 实例强制初始化同步。
a.关闭 mongod 进程。通过在 mongo 窗口中使用 db.shutdownServer() 命令或者在Linux系统中使用 mongod --shutdown 参数来安全关闭。
b.清空复制集节点的数据目录和其子目录，清除 dbPath 中的数据，MongoDB将会进行重新复制。可以考虑在这么做之前先做备份以防万一。
这时， mongod 将会进行初始化复制。初始化复制的耗时，将取决于数据库数据量和两节点之间的网络情况。
初始化复制将会影响其他节点，也会加大主节点的网络流量压力，且只会在有一个节点数据是最新的且连接无问题的时候进行。
通过从其他节点复制数据文件来同步
本方法通过使用已有节点上的数据文件来进行。数据文件 必须 是较新的（能够追上 oplog ）.不然的话该节点还是需要进行初始化复制。
复制数据文件
我们可以直接复制数据文件也可以通过镜像。然而，大多数情况下，我们不应该复制未关闭的 mongod 实例的数据文件，因为复制过程中数据文件是会变动的。
重要
在复制数据文件的时候，我们也必须复制 local 数据库的数据文件。
我们*不应该*使用 mongodump 的备份作为数据文件，仅使用文件快照 。关于如何在运行中的 mongod 实例中获得一致性的数据文件，参考 MongoDB备份方案 。
同步节点
在我们复制了其他节点的数据文件后，启动 mongod 实例，其会追赶最新的数据直到数据一致。
CentOS编译安装MongoDB
CentOS 编译安装 MongoDB与mongoDB的php扩展
CentOS 6 使用 yum 安装MongoDB及服务器端配置
Ubuntu 13.04下安装MongoDB2.4.3
《MongoDB 权威指南》(MongoDB: The Definitive Guide)英文文字版[PDF]
基于CentOS 6.5操作系统搭建MongoDB服务 uxidc.com/Linux/2014-11/108900.htm