本节详述影响 Fedora 9 图形桌面用户的改变。
GNOME
本次发布包含 GNOME 2.22。
GNOME 欢迎屏幕被上游开发者禁止了。要启用它，使用 gconf-editor 或下面的命令:
gconftool-2 --set /apps/gnome-session/options/show_splash_screen --type bool true
本次发布中，锁定屏幕对话框并未连接到指定的屏幕保护程序。要启用它，使用 gconf-editor 或下面的命令:
gconftool-2 --set --type string /apps/gnome-screensaver/lock_dialog_theme "system"
这次发布中，插入点（光标）闪烁被默认激活。该配置由一个 gconf 注册表条目来控制。要将之禁用，运行以下命令：
gconftool-2 --type bool --set /desktop/gnome/interface/cursor_blink false
101.1. Gvfs
GNOME 2.22 提供了全新的 Gvfs，一个用户空间的虚拟文件系统。该系统支持 sftp，ftp，dav，smb，obexftp，以及其他多种协议。Gvfs系统接替了其前身gnome-vfs。
Gvfs 包含两个部分：
GIO，一个共享库，是 GLib 的一部分，并且为·
Gvfs是一个包含多种文件系统类型和协议的工具。
Gvfs 系统启动一个单独的服务程序，gvfsd 来维护 gvfs 连接。客户通过 DBus调用和一个自定义协议来完成通讯（后者用来传输文件内容）。
一些过去被gnome-vfs 支持的文件系统，现在可能尚未被gvfs所支持。相应的工作正在紧锣密鼓的进行中。
GNOME 显示管理工具
GNOME 显示管理器 (gdm) 被更新到最新的主流版本，该版本是对代码的一次完整重写。该工作由 Fedora 开发人员主导。
PolicyKit 可以被用来控制系统的关机和重启。由于将要被新的工具替代，配置工具 gdmsetup 没有被提供。
登录屏幕中其他的新功能包括:
登录屏幕上的电源和监测,·所以笔记本电脑会在电池电量低的时候休眠或关机。
用户列表
在登录窗口和桌面会话之间的公共默认背景，中间不闪烁
注意：~/.Xclients 和 ~/.xsession 在登录时不再自动读取。如果你使用了这些文件之一，那么安装xorg-x11-xinit-session软件包。
KDE
这次发行集成了 KDE 4.0.3。由于软件包kdepim 和 kdevelop 不是 KDE 4.0 的一部分，以及kdewebdev 的 KDE 4.0 版本尚为完成，以上软件仍采用 KDE 3.5.9 中的版本。
KDE 4.0 提供了对核心组件的重大更新；比如，升级到 QT 4。KDE 4.0 同时也提供了一系列新的框架，比如：一套新的多媒体 API：Phonon，一套硬件整合框架：Solid，一套新的桌面和面板管理工具：Plasma，整合的桌面搜索，KWin中的桌面特效，新的视觉主题 Oxygen。KDE 4.0.3 是 KDE 4 系列的一个 错误修正版。
Fedora 9 不包含 老的 KDE 3 桌面。但是 Fedora 提供一个兼容 KDE 3的开发环境，以用在 KDE 4 和其他桌面环境下来编译和运行 KDE 3 程序。参阅向前兼容性 部分以获得更多的信息。
由于 networkmanager 同这次发行中包括的 NetworkManager 不相容，KDE Live 镜像使用NetworkManager-gnome 中的 nm-applet 来作为替代。注意 gnome-keyring-daemon 被用来存储网络密码。(已经不再需要 Fedora 8 中的 knetworkmanager，因为其仅仅安装一个符号链接来调用 nm-applet。)
由于内置的窗口管理器 KWin 现在可选地支持合成和桌面特效，KDE Live 镜像不再包括 Compiz/Beryl。KWin 中合成/特效模式默认被禁用，但是可以通过 systemsettings 来启用。Compiz (和KDE 4集成)可以通过安装compiz-kde软件包从资源库中获得。
工作区的变化
Plasma 替换了原来的 Kicker 和 KDesktop 程序。Plasma 同时管理面板和桌面。所以，现在可以将Plasma 小程序放置到桌面和面板上，如果面板可以容得下该小程序。
旧的·KDE·控制中心·(KControl)·被·System·Settings·(systemsettings) 替代.
KDM 登录屏幕使用一个新的主题文件格式。因此，KDE 3中的 KDM 主题无法在 KDE 4 中工作。KDM 现在内置了主题配置功能，所以不再需要单独的 kdmtheme 命令。
以上所有应用程序可以在 kdebase-workspace 软件包中找到。
软件包和应用程序的变化
软件包·qt·,·kdelibs·和·kdebase·现在代表 KDE 4 版本,·在以前的 Fedora 版本中以·qt4·,·kdelibs4·和·kdebase4·出现.
Qt 3 和 KDE 3 被命名为 qt3，kdelibs3 和 kdebase3。 Fedora 9 只包括了 kdebase3 中的一部分。参见 前向兼容性 部分。
主流 KDE 将 kdebase 模块分为了 3 个部分：kdebase-runtime，kdebase (有时也被称为 kdebase-apps，以示同 kdebase 的区别)，和 kdebase-workspace。 Fedora 中体现了这一变化。
Fedora 9 新增了 kdegames3 软件包，提供尚未移植到 KDE 4 环境的 KDE 游戏。
Dolphin 进入了 kdebase，并且替换了原有的d3lphin。
kdebase-workspace 软件包现在提供对KDM 主题的配置，从而替换了kdmtheme。
Okular 替换了 KPDF，KGhostView，和 kdegraphics 中的 KFax。
kaider 软件包替换了 KBabel。后者曾是 kdesdk 的一部分。
okteta 软件包替换了KHexEdit。后者曾作为 kdeutils 的一部分。
kalgebra 软件包和 marble 现在成为了 kdeedu 软件包的一部分。
ksudoku 软件包现在是 kdegames 的一部分。
gwenview 现在是 kdegraphics 的一部分。
kiconedit 和 kcoloredit 软件包， 已经从 kdegraphics 中独立出来了。
kmid 曾是 kdemultimedia 的一部分，现在已经是一个独立的软件包。