在业务低峰期执行上述操作，比如创建删除索引。
在到RDS的数据库连接建立后，设置会话变量 autocommit 为 1 或者 on，比如 set autocommit=1; 或 set autocommit=on; 。
考虑使用事件来终止长时间运行的事务，比如下面的例子中会终止执行时间超过60分钟的事务。
create event my_long_running_trx_monitor on schedule every 60 minute starts '2015-09-15 11:00:00' on completion preserve enable do begin declare v_sql varchar(500); declare no_more_long_running_trx integer default 0; declare c_tid cursor for select concat ('kill ',trx_mysql_thread_id,';') from information_schema.innodb_trx where timestampdiff(minute,trx_started,now()) >= 60; declare continue handler for not found set no_more_long_running_trx=1; open c_tid; repeat fetch c_tid into v_sql; set @v_sql=v_sql; prepare stmt from @v_sql; execute stmt; deallocate prepare stmt; until no_more_long_running_trx end repeat; close c_tid; end;
注：请根据您自身情况，自行修改运行间隔和事务执行时长。
执行上述1中操作前，设置会话变量 lock_wait_timeout 为较小值，比如 set lock_wait_timeout=30; 命令可以设置 metadata lock wait 的最长时间为 30 秒；避免长时间等待元数据锁影响表上其他业务查询。