5、接下来在工程目录下新建jni目录，把bin\jni目录下的.h头文件移动到此目录下，并且在目录下编写minQ_Android_Jnitest.c文件和Android.mk文件。
minQ_android_Jnitest.c文件内容：
#include<stdlib.h>
#include<stdio.h>
#include"minQ_android_Jnitest.h"//include刚才生成的头文件
jstring Java_minQ_android_Jnitest_speak(JNIEnv* env, jobject this){
return (*env)->NewStringUTF(env,"This is the first NDK program!");
}
说明：jstring表示Java字符串，Java_minQ_android_Jnitest_speak的构成为Java_<包名称>_<类>_<函数>，其中<函数>的名称和参数要与Jnitest.java文件定义的函数一致。
Android.mk文件内容：
LOCAL_PATH :=$(call my-dir)
include $(CLEAR_VARS)
LOCAL_MODULE :=myjni
LOCAL_SRC_FILES :=minQ_android_Jnitest.c
include $(BUILD_SHARED_LIBRARY)
说明：LOCAL_PATH := $(call my-dir) 一个Android.mk 文件首先必须定义好LOCAL_PATH变量。它用于在开发树中查找源文件。在这个例子中，宏函数’my-dir’, 由编译系统提供，用于返回当前路径（即包含Android.mk file文件的目录）。
include $( CLEAR_VARS) CLEAR_VARS由编译系统提供，指定让GNU MAKEFILE为你清除许多LOCAL_XXX变量（例如LOCAL_MODULE, LOCAL_SRC_FILES, LOCAL_STATIC_LIBRARIES, 等等...),除LOCAL_PATH 。这是必要的，因为所有的编译控制文件都在同一个GNU MAKE执行环境中，所有的变量都是全局的。
LOCAL_MODULE := myjni编译的目标对象，LOCAL_MODULE变量必须定义，以标识你在Android.mk文件中描述的每个模块。名称必须是唯一的，而且不包含任何空格。
注意：编译系统会自动产生合适的前缀和后缀，换句话说，一个被命名为'myjni'的共享库模块，将会生成'libmyjni.so'文件。
重要注意事项：
如果你把库命名为‘libmyjni’，编译系统将不会添加任何的lib前缀，也会生成 'libmyjni.so'，这是为了支持来源于Android平台的源代码的Android.mk文件，如果你确实需要这么做的话。
LOCAL_SRC_FILES := myjni.c LOCAL_SRC_FILES变量必须包含将要编译打包进模块中的C或C++源代码文件。注意，你不用在这里列出头文件和包含文件，因为编译系统将会自动为你找出依赖型的文件；仅仅列出直接传递给编译器的源代码文件就好。
注意，默认的C++源码文件的扩展名是’.cpp’. 指定一个不同的扩展名也是可能的，只要定义LOCAL_DEFAULT_CPP_EXTENSION变量，不要忘记开始的小圆点（也就是’.cxx’,而不是’cxx’）
include $(BUILD_SHARED_LIBRARY) BUILD_SHARED_LIBRARY表示编译生成共享库，是编译系统提供的变量，指向一个GNU Makefile脚本，负责收集自从上次调用'include $(CLEAR_VARS)'以来，定义在LOCAL_XXX变量中的所有信息，并且决定编译什么，如何正确地去做。还有 BUILD_STATIC_LIBRARY变量表示生成静态库：lib$(LOCAL_MODULE).a， BUILD_EXECUTABLE 表示生成可执行文件。
完成到这里，jni目录下就有三个文件：
6、此时我们可以启动cygwin编译我们的工程。myjni是apps目录下的应用程序目录名称。在指定应用程序（目录）名称后，NKD编译系统会首先找到目录中的Application.mk文件，根据Application.mk文件的信息，确定该Android共享需要使用的APP_MODULES模块；然后在jni目录中搜索所有Android.mk文件，在找到与APP_MODULES模块匹配的Android.mk文件后，根据Android.mk文件提供的信息编译指定的C/C++源代码文件，形成共享库文件；最后将生产的共享库文件拷贝到Android工程的指定目录中。
说明：启动cygwin后，直接输入命令cd $NDK可以进入ndk安装目录，然后进入myjni工程目录，输入命令$NDK/ndk-build （以上说用的$NDK对应于你在安装cygwin时操作bash_profile文件在后面添加的名称一样，见三.2步）。
7、打开工程myjni目录，会发现在该目录下自动生成两个文件：libs和obj。生成的.so文件在libs\armeabi目录下。在eclipse下刷新工程，重新编译生成apk，libhello-jni.so共享库会一起打包在apk文件内。然后可以顺利地运行你的第一个NDK程序了！