1)Windows下都是administrator用户登录，病毒可以自由感染系统任何文件;Ubuntu下普通用户不能修改系统文件。
2)Windows用户很多，研究的人也多，病毒，木马数量也很多，被攻击的数量也很多，攻击Windows终端用户有很多商业利益，如偷qq号，偷银行交易密码等等，有利益驱动研究的人也越多，“成果”也就越多；linux当前还没有普及所以病毒很少。
二、木马
同上
三、流氓软件
同上
四、常见攻击和入侵
同上，但需要补充一下，攻击者通常攻击两个方向：
a)终端用户，偷取个人信息
b)服务器，一次性获取巨额利益，比如攻击银行IBM AIX / HP-UX 等等大机，目前Ubuntu两者都不算，所以很安全
五、系统设计架构上的差异
1. Win2k没有栈保护，很容易溢出/Win2k malloc攻击也没有加强;WinXP稍有加强，但相对还是容易；Win2003加强了很多，很难攻击了，现在的芯片也都有栈不可执行保护了，XP sp2以后和2003都利用了此特性，这将很难实施溢出攻击
2. Linux kernel 2.6以后的版本很多默认开启了栈保护功能，而起2.4 kernel很久前就有非官方的PAX内核补丁，加强了对抗溢出攻击，可以说早就达到了2003的标准，kernel 2.6现在的版本都内置了此功能
3. 大的服务器芯片+OS: SPARC+Solaric / PowerPC + AIX / PA + HP-UX 等在9x年就有了芯片+内核的栈不可执行保护机制
六、关于Ubuntu安全性的其它建议
1. 关闭所有对外服务，如ssh
2. 开启iptables，只让需要访问你的人能连上你