手机系统本身的指纹认证和门禁系统中的指纹认证并无本质区别：用户首先录入指纹，基于安全考虑，指纹的特征数据也是保存在手机本地；使用指纹进入系统时也是先提取当前的特征值，然后和本地的指纹库进行比对，匹配上了就能进手机入系统。
和门禁系统不同的一点是，手机中用户需要有一个能进入系统的密码，可以是字符密码，也可以是手势密码，当用户的指纹无法使用时（可能是指纹模块故障，也可能是用户指纹问题），仍然能有其它方式进入手机；门禁系统中用户则可以只有指纹认证这一种方式，进不了门时，还可以找管理员。
当然只使用手机本地认证也是有意义的，每次APP从后台切换到前台时都需要用户刷指纹，以验证当前操作用户的身份，很多的银行APP就是这样做的（其实我并未确认这些APP此时有没有去后台再次验证，只是认为这是一种有意义的认证方式）。
本机认证的安全性手机操作系统厂商们已经做的很好了，指纹的注册和识别都在安全区域内进行，指纹识别的结果可以加密的方式返回给APP，这块直接应用就可以了。
远程认证远程认证就是客户端和服务端之间的认证，完整的方式就是双向认证：客户端要验证服务端的身份，以免被套取信息；服务端要验证客户端的身份，以免用户身份被冒充。
客户端验证服务端的身份：现在都使用https了，https证书就是服务端身份的保证，至少可以保证访问到地址就是你想访问的域名地址，高级点的证书还能标识证书所有者的身份；使用https时数据也是加密传输的，所以一般应用场景是没问题的。但是也发生过滥发证书的情况，所以如果需要更高的安全级别，服务端可以再生成一对非对称密钥。公钥发给APP，私钥自己保存好，每次认证时，客户端先采用服务端的公钥对数据进行加密，然后再发送出去，服务端再采用自己的私钥进行解密，如此假冒的服务端就不能解密数据，就什么也得不到；服务端返回给客户端的数据带上私钥对数据的签名，客户端可以验证签名，验证通过则代表是服务端返回的，就可以应用这些数据。
服务端验证客户端的身份：也是通过非对称密钥的方式，客户端生成一对非对称密钥，私钥自己保存好，公钥发送到服务端。指纹认证通过后客户端使用私钥对请求参数进行签名，然后再发送出去，服务端使用客户端公钥对接收到的数据签名进行验证，如果验证通过，则说明数据没有被篡改，可以处理客户端发起的业务请求。
开启指纹认证这里以登录为例，来看看如何使用指纹认证来做APP登录。还是先要注册指纹，具体过程如下图所示：
5开启指纹：开启指纹登录的时机，一般都是先用别的方式登录了APP，然后再开启指纹登录。但是也有一些例外，用户使用APP时直接使用第三方登录，第三方提供了指纹登录的方式，比如使用Apple Id登录。上边图中是先用账号密码登录了系统，然后才开启的指纹认证。
12对比系统存在的指纹：指纹数据始终保存在手机本地，不会上传到远程。目前市面上的手机都是这样做的，Android和iOS提供的指纹认证API都只返回true或者false的认证结果，这样可以避免云服务被攻破时导致大规模泄漏的严重后果，最大限度的保护用户生物特征数据的安全。
13指纹验证成功：本地指纹认证通过就代表用户身份验证通过，不管是哪个手指。早期的操作系统版本中可能能够获得是使用的哪个指纹，但是现在一般都不开放了，只能得知指纹集是否发生了变化（删除或者添加了指纹），此时App可以强制用户退出，再使用其它安全的方式登录，然后再让用户决定是否开启指纹，支付宝就是这样做的。
重放攻击问题：步骤16中的请求可能被人截获，虽然无法解密，但是可以多次发向服务端，造成重放攻击的问题，可以引入一个挑战码来解决这个问题。步骤8初始化指纹注册请求时服务端可以生成这个挑战码，然后在步骤16中携带这个挑战码，然后在服务端进行验证。
使用指纹认证下边再来看下使用指纹登录的过程：
登录时的本机指纹认证和注册时的本机指纹认证方法相同，只不过这次是在用户选择指纹登录时弹出指纹刷取页面。