你还可以根据你的习惯修改一下项目的相关配置，我自己习惯将java文件编译到WebContentWEB-INFclasses下，这个你可以点击Source的tab，修改default output folder的内容。另外注意下图中的Apache tomcat v6.0这是引入的Server对应的一堆jar包，而Web App libraries是指你项目下的WebContent/lib下的所有的jar包，当你在WebContent/lib下添加新jar的时候，就不需要自己Add Jars了。
在项目根目录上右键，然后run as，选run on server，就可以在eclipse里运行该项目了。
断点调试
在创建了Server和Dynamic Web Project后，调试java代码，只要在运行项目时选择Debug As就可以了，另外还有种方式是Remote Java Project。
这种方式需要再给tomcat写个脚本
debug.bat
1SET CATALINA_OPTS=-server -Xdebug -Xnoagent -Djava.compiler=NONE -Xrunjdwp:transport=dt_socket,server=y,suspend=n,address=58882call startup.bat小技巧
如下，会持续补充中:
当你的项目比较大又想在eclipse里启动tomcat来运行的话，常常会因为超时而失败，这时可以双击Servers的view里的某个Server，这时会出现，下图上半部分的内容，可以在Timeouts里将超时时间加长