此前的1月22日，网友“921440435”在百度(155.05, 2.95, 1.94%)显卡吧里发了一个帖子《国产COS操作系统测试机到手！》，附上了测试样机HTC手机的照片。甚至出现了COS手机连接到电脑之后，利用刷机精灵进行操作系统检测，得出的结果是该机系统为Android 4.1.2。
正是这个帖子发布之后，人们开始强烈质疑COS系统与HTC Sense系统有着某种联系，COS系统并不是真正的自主研发。
在采访中，“921440435”网友告诉记者，他所拿到的测试样机，虽然包装上产品型号贴着“COS手机版1.0”，但是把贴纸撕了，可看到盒子原本包装就是HTC 9088。而且经软件测试，该款手机也的确是HTC 9088。
“这意味着什么？”记者问。
“什 么都不意味，我曾经向COS的客服人员咨询过这一问题，对方并没有回避这个问题，他们承认这的确就是市面上销售的HTC 9088手机，只不过从底层刷入了COS操作系统。”这位网友说。(HTC 9088是移动定制版的HTC Butterfly S，配备5英寸1080p触控屏，搭载主频1.9GHz的高通APQ8064T四核处理器，内置2GB内存和16GB机身存储空间。)
外界对中科院软件研究所的这种做法存在很大质疑，认为这说明了COS就是直接剽窃HTC Sense系统。
但如果单就这一点并不足以下结论断定COS剽窃Android。因为在IT研发领域面，这种做法很正常。曾经在摩托罗拉中国研发中心供职的一位工程师解释了这种设计规则：毕竟中科院研发的不是手机，而是手机操作系统，他们没必要为自己的COS系统专门开发一部手机出来。HTC手机不过是他们的一个系统硬件载体而已，并不是想外界想象的那样存在剽窃HTC Sense系统的事情。
但 这位工程师同时也强调，当然并不是说随便谁都可以去市场上买个手机，然后将自己研发的产品植入手机底层系统，这里涉及到手机硬件系统和底层代码兼容的问 题，必须要手机厂商开放权限才可能，这方面中科院软件研究所肯定与HTC进行过沟通甚至合作，否则是不可能将一个底层操作系统直接植入HTC手机平台的。
“你觉得COS跟Android到底有多大关联？”记者最后向“921440435”网友提出这样一个问题。
这 位网友想了一下，告诉记者，大家都以为COS就是Android系统，只不过是在Android系统上做得深度优化，“但我认为COS系统绝对不是 Android，只是它从研发开始就是一直模仿Android而已。Android作为iOS以外最大的智能操作系统，各方面都相当成熟，所以COS与之 差不多可以理解。”
COS背后的三方迷局
中科院软件研究所、HTC、上海联彤，这三者到底是怎样一个关系，也是这次COS研发风波的焦点。
在COS正式发布之后，网上就流传一种说法：COS其实就是 HTC 前设计主管简志霖以 2000 万元价格卖到内地的Sense 6.0手机系统，上海联彤以及中科院软件所就是在Sense 6.0手机系统基础上开发出COS智能操作系统。
而在中科院软件研究所公布的宣传视频上，这一款操作系统的演示样机全部使用了HTC手机，其中一款为HTC butterfly，另一款为HTC one。
另外记者在采访中了解到，在Android取得成功之后，作为手机大厂的HTC公司曾经想独立开发一套操作系统，因此成立了一个项目小组。该项目在HTC内部叫做Gaia，正式名字就叫COS。
那么，会不会是上海联彤将HTC这个项目购买回来之后进行二次开发或者再加工呢？
面对种种争议，COS研发者方面断然否认。
中科院软件研究所总体部主任武延军直截了当地告诉记者，COS系统由中科院独立完成开发，与HTC公司无任何关系。
“COS系统基于Linux内核开发，除了少数内容，几乎都是我们自己开发的。当中涉及到近千万的代码，都是我们自己开发，这部分可以作为自主知识产权。”
而作为联合开发者的上海联彤网络通讯技术有限公司在COS项目中到底起什么作用，武延军也给出了解释：联彤主要负责消费电子产品的研发和商业化运作。他们与威盛电子有一些联系，但都属于COS产业链合作伙伴，中科院软件研究所目前和HTC没有任何关系。
上海联彤并没有否认自己与HTC的联系，但强调跟HTC的联系并没有任何问题，属于正常范畴，“COS是一套操作系统，最终搭载在不同的终端上。在研发的过程中，我们和很多终端厂商有过交流，其中包括诺基亚、联想、HTC、中兴、酷派、天语、TCL、康佳等。也有厂商在其现有硬件平台上适配过COS。 COS对所有的终端厂商开放，也欢迎各个终端厂商在自己的平台上适配、测试、评估COS，推出COS的产品，我们相信会有很多终端厂商推出COS的产品。”