Linux CentOS下安装MPICH以及运行第一个并行程序

一:Linux下安装与配置MPICH

为了在Linux下运行我们的并行程序,我们需要安装MPICH,现在的版本是MPICH2,下载地址:mpich2-1.5.tar.gz  [文件大小:21.77 MB] 下载: 

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在 2012年LinuxIDC.com\10月\Linux CentOS下安装MPICH以及运行第一个并行程序

下载方法见

下载完成后,用SSH登录Linux系统,在这里我用的root的登录身份。在/home 下创建一个目录,用来表示某个用户的文件 mkdir  houqingdong  , 将tar.gz(注意,这里是tar.gz后缀的压缩文件,不一样的压缩文件在Linux下解压缩时所用的命令也不一样),还要注意一点,就是解压缩文件的过程一定要在Linux系统下完成,(起初的时候我是在Windows下解压完成的,将解压完成后的文件夹直接上传到Linux下,在安装执行./configure时会出现错误!!)。

现在我们解压缩文件:tar -zxv -f mpich2-1.5.tar.gz(这里是你自己的压缩文件) ,然后会出现具体的解压缩过程,解压完毕后,在/home 下会出现mpich2-1.5这个文件夹

进入该文件夹:cd mpich2-1.5  ,进入之后,接下来我们要做的工作就是要配置它的安装目录,在这之前我们先在houqingdong文件夹下创建我们存放MPICH程序的文件夹,假如该文件夹为mpiexe :  cd /home/houqingdong    mkdir  mpiexe  ,创建完成后,就执行  ./configure -prefix=/home/houqingdong/mpiexe  就是配置我们的安装目录,这里同样会等待一段时间,等成功执行后,在mpich2-1.5下会生成mkfile文件,这里我们执行的时候有时会出现这样的提示:-bash: ./configure: Permission denied 这句话是提醒我们权限不够,仔细看一下会发现configure没有x(执行)权限,这里我们要执行: chmod +x ./configure 即可,这句指令的意思是为configure增加x的权限

再一次执行:./configure -prefix=/home/houqingdong/mpiexe  同样会等一段时间,最终执行完后不会报错,才能继续向下执行,如果发生某些错误,请参考:

上一步执行完我们接着执行: mkfile

执行完mkfile, 然后开始实际的安装 执行  mkfile install,就会看到程序正在安装,安装完成后进入/home/houqingdong/mpiexe可以看到多出了很多像bin  include  lib样的文件。

先在将我的第一个并行文件上传到/home/houqingdong/目录下:

程序为:

#include "mpi.h" 

#include <stdio.h> 

 

int main (int argc, char *argv[]) { 

   int i; 

   int id;               /* Process rank */ 

   int p;                /* Number of processes */ 

   void check_circuit (int, int); 

 

   MPI_Init (&argc, &argv); 

   MPI_Comm_rank (MPI_COMM_WORLD, &id); 

   MPI_Comm_size (MPI_COMM_WORLD, &p); 

 

   for (i = id; i < 65536; i += p) 

      check_circuit (id, i); 

 

   printf ("Process %d is done\n", id); 

   fflush (stdout); 

   MPI_Finalize(); 

   return 0; 

 

 

/* Return 1 if 'i'th bit of 'n' is 1; 0 otherwise */ 

#define EXTRACT_BIT(n,i) ((n&(1<<i))?1:0) 

 

void check_circuit (int id, int z) { 

   int v[16];        /* Each element is a bit of z */ 

   int i; 

 

   for (i = 0; i < 16; i++) v[i] = EXTRACT_BIT(z,i); 

   if ((v[0] || v[1]) && (!v[1] || !v[3]) && (v[2] || v[3]) 

      && (!v[3] || !v[4]) && (v[4] || !v[5]) 

      && (v[5] || !v[6]) && (v[5] || v[6]) 

      && (v[6] || !v[15]) && (v[7] || !v[8]) 

      && (!v[7] || !v[13]) && (v[8] || v[9]) 

      && (v[8] || !v[9]) && (!v[9] || !v[10]) 

      && (v[9] || v[11]) && (v[10] || v[11]) 

      && (v[12] || v[13]) && (v[13] || !v[14]) 

      && (v[14] || v[15])) { 

      printf ("%d) %d%d%d%d%d%d%d%d%d%d%d%d%d%d%d%d\n", id, 

         v[0],v[1],v[2],v[3],v[4],v[5],v[6],v[7],v[8],v[9], 

         v[10],v[11],v[12],v[13],v[14],v[15]); 

      fflush (stdout); 

   } 

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