可能不少人持这样一种观点，认为 Linux 病毒少是因为Linux不像Windows那么普及，其实这种观点很早已经被人批驳过了，一个最有力的论据是：如果写病毒的人写 Windows 病毒是因为 Windows 用户多而因此破坏性大，那么 Internet 上大多数服务器都是基于 Unix/Linux 的，攻击这些服务器，破坏性岂不是更大么？
对一个二进制的 Linux 病毒，要感染可执行文件，这些可执行文件对启动这个病毒的用户一定要是可写的。而实际情况通常并不是这样的。实际情况通常是，程序被 root 拥有，用户通过无特权的帐号运行。而且，越是没有经验的用户，他拥有可执行文件的可能性就越小。因此，越是不了解这种危险的用户的主目录越不适合病毒繁殖。
即使这个病毒成功地感染了这个用户拥有的一个程序，由于这个用户权限受限，它进一步传播的任务也会非常困难（当然，对于运行单用户系统的 Linux 新手，这个论证可能不适用。这样的用户可能会对 root 帐户比较粗心）。
Linux 网络程序构建地很保守，没有使现在 Windows 病毒如此快速传播变的可能的高级宏工具。这并不是 Linux 的固有特征；它仅仅是两种用户基础的不同和这种不同导致的在这两种市场中的成功产品的不同的反映。通过观察这些问题学到的经验也会被用到将来的 Linux 产品中。