1997年代亚洲经济危机爆发后，日本大大小小的智库纷纷面临资金来源压力问题。伴随着“平成萧条”，来自政府、企业及个人的项目来源大大减少。大中型企业大量破产倒闭导致其旗下所成立的各类智库型研究机构也不得不解散关门。日本智库在这一阶段走向低迷，同时向多元化和非营利性方向发展。
二、日本智库发展的总体现状
（一）日本智库国际排名
美国宾夕法尼亚大学最新发布的《2019年全球智库报告》显示，2019年全球共有8248家智库，其中美国智库数量为1871家，排名第二的印度智库数量为509家，中国以507家智库排名第三。日本虽然排名全球第九，共有128家智库，但智库平均水准都非常之高。日本国际问题研究所（Japan Institute of International Affairs ，简称JIIA）排名全球第十三，亚洲开发银行（Asian Development Bank Institute ，简称ADBI）排名全球第二十四，中曾根平和研究所（Institute for International Policy Studies ，简称IIPS）排名全球第117，防卫研究所（National Institute for Defense Studies ，简称NIDS）排名全球第138。其中亚洲开发银行（简称“亚开行”）较为特殊，其属于亚太区政府间金融机构，旨在促进亚洲经济与社会协调发展，然而由于亚开行历代总裁皆为日本人，且日本在亚开行持股比例最大，占15.67%之多，故宾夕法尼亚大学在统计时将亚开行算做日本智库。一贯重视信息收集和调查研究的日本官产学界均高度重视智库产业建设，使得智库成为日本政府、社会和企业管理中不可或缺的决策支持机构。[3]
（二）日本智库的主要类型
日本智库按其经费来源主要可以分为三类，一类是株式会社类（Corporation），如株式会社野村综合研究所（NRI）、株式会社三菱综合研究所（MRI）、株式会社日本综合研究所（JRI）等，为公司制营利性智库；一类是非营利性非政府组织，如全球排名第13的日本国际问题研究所（JIIA）、日本综合研究开发机构（NIRA）、中曾根康弘世界平和研究所（NPI）皆为财团法人组织（Foundation）；还有一类为官方研究所，是直接服务与政府的智库，如隶属于内阁的日本经济社会研究所（ESRI）和2019年排名全球第138名、隶属于日本防卫省的防卫研究所（NIDS）。
三、日本高端智库的几个典型
（一）日本国际问题研究所（JIIA）
日本国际问题研究所（JIIA）成立于1959年，由日本前首相吉田茂仿效美国对外关系协会和英国皇家国际事务研究所（Chatham House）所建立，首届主席由吉田茂亲自担任。成立伊始，日本国际问题研究所隶属于日本外交部，后于2012年将其性质变更为公益财团法人。自成立五十多年来，日本国际事务研究所致力于进行有关日本外交与安全方向的研究，并提出了许多具有影响力的政策建议。
日本国际问题研究所共有120位公司会员及540位个人会员。个人会员主要以研究人员为主，会费在8000日元至14400日元不等[4]（约500至1000人民币），根据其会员等级的不同，包含了活动邀请、电子杂志阅读、数据库资料下载（该研究所自1960年4月起发表的文献资料，国际问题重要年表，以及其国际事务相关文献等）、讲座视频观看、与外国智库交流机会、会员价购买出版书籍，以及研究所内图书馆的使用等不同权益。企业会员包括了日立、东芝、三菱、住友、ANA、读卖新闻等各大日企。日本国际问题研究所的研究员来自立命馆大学、新泻县立大学、成蹊大学、庆应义塾大学等著名高校，资金来源包括了日本政府、企业及其他机构和个人所缴纳的会费、发行出版物所获收益，以及通过特殊补贴获得的其他收入。据日本国际问题研究所2019年财报显示，其年收入为11.34亿日元（约人民币7457万人民币）、出版收入300万日元（约19.7万人民币）、项目委托收入2.64亿日元（约1745万人民币）、会费收入6420万日元（约422万人民币）、政府补助8亿日元（约5257万人民币）[5]，可见其主要收入来源于政府补助。
日本国际问题研究所通过与世界其他高端智库合办各类关于日本外交和国防政策为内容的专题研讨会和高端对话，使得其在世界声名大噪。据其章程显示，日本国际问题研究所主要目标是对国际事务进行研究，并对日本外交政策进行科学分析审视，从而提供相应的建设性政策意见和建议；传播国际事务知识，鼓励日本各个大学及研究机构参与到事国际事务的研究中来；协助形成有利于日本的世界舆论，确保日本外交事务正确发声；促进世界和平繁荣与发展[6]。